Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn13Q3UW68 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn13Q3UW68 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms