Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mccc2Q3ULD5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mccc2Q3ULD5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms