Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc61Q3UJV1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc61Q3UJV1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms