Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zswim8Q3UHH1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zswim8Q3UHH1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zswim8Q3UHH1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms