Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Trafd1Q3UDK1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trafd1Q3UDK1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trafd1Q3UDK1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms