Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vars2Q3U2A8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vars2Q3U2A8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vars2Q3U2A8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms