Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem35bQ3U0Y2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem35bQ3U0Y2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem35bQ3U0Y2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem35bQ3U0Y2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem35bQ3U0Y2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem35bQ3U0Y2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem35bQ3U0Y2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem35bQ3U0Y2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem35bQ3U0Y2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem35bQ3U0Y2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem35bQ3U0Y2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem35bQ3U0Y2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem35bQ3U0Y2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem35bQ3U0Y2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Tmem35bQ3U0Y2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms