Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLH4

Prrc2c, Protein PRRC2C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2cQ3TLH4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrc2cQ3TLH4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2cQ3TLH4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 556.6 ms