Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem104Q3TB48 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms