Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccbe1Q3MI99 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccbe1Q3MI99 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms