Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fam171bQ14CH0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fam171bQ14CH0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms