Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn2bQ0KL01 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms