Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cass4Q08EC4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms