Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbp2Q08652 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbp2Q08652 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms