Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc4Q08624 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxc4Q08624 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms