Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
F13bQ07968 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
F13bQ07968 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13bQ07968 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13bQ07968 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13bQ07968 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F13bQ07968 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13bQ07968 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13bQ07968 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms