Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Thbs3Q05895 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thbs3Q05895 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms