Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk18Q04899 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms