Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Top1Q04750 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Top1Q04750 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top1Q04750 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top1Q04750 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top1Q04750 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top1Q04750 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top1Q04750 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top1Q04750 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top1Q04750 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Top1Q04750 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Top1Q04750 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Top1Q04750 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Top1Q04750 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Top1Q04750 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms