Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacna1sQ02789 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cacna1sQ02789 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cacna1sQ02789 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms