Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ctnnb1Q02248 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms