Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ly9Q01965 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ly9Q01965 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms