Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd80Q00609 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd80Q00609 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd80Q00609 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd80Q00609 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd80Q00609 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd80Q00609 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd80Q00609 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd80Q00609 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd80Q00609 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd80Q00609 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd80Q00609 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd80Q00609 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd80Q00609 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd80Q00609 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd80Q00609 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd80Q00609 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd80Q00609 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd80Q00609 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd80Q00609 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd80Q00609 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd80Q00609 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd80Q00609 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd80Q00609 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cd80Q00609 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms