Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax8Q00288 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms