Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbbp6P97868 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp6P97868 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms