Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AlkP97793 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AlkP97793 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AlkP97793 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AlkP97793 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AlkP97793 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AlkP97793 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AlkP97793 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AlkP97793 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AlkP97793 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AlkP97793 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
AlkP97793 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
AlkP97793 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
AlkP97793 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
AlkP97793 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
AlkP97793 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
AlkP97793 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
AlkP97793 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
AlkP97793 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AlkP97793 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AlkP97793 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AlkP97793 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AlkP97793 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AlkP97793 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AlkP97793 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AlkP97793 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AlkP97793 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AlkP97793 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AlkP97793 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AlkP97793 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AlkP97793 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AlkP97793 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AlkP97793 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
AlkP97793 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AlkP97793 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AlkP97793 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
AlkP97793 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AlkP97793 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AlkP97793 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AlkP97793 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AlkP97793 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AlkP97793 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AlkP97793 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
AlkP97793 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AlkP97793 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AlkP97793 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AlkP97793 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AlkP97793 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AlkP97793 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AlkP97793 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AlkP97793 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AlkP97793 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AlkP97793 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AlkP97793 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AlkP97793 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
AlkP97793 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AlkP97793 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AlkP97793 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AlkP97793 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AlkP97793 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AlkP97793 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AlkP97793 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AlkP97793 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AlkP97793 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AlkP97793 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AlkP97793 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AlkP97793 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AlkP97793 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AlkP97793 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AlkP97793 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
AlkP97793 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AlkP97793 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AlkP97793 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AlkP97793 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
AlkP97793 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
AlkP97793 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AlkP97793 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AlkP97793 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AlkP97793 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AlkP97793 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AlkP97793 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AlkP97793 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AlkP97793 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AlkP97793 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AlkP97793 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AlkP97793 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AlkP97793 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AlkP97793 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AlkP97793 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AlkP97793 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AlkP97793 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
AlkP97793 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
AlkP97793 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AlkP97793 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AlkP97793 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AlkP97793 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AlkP97793 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AlkP97793 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AlkP97793 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AlkP97793 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms