Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smarcc1P97496 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smarcc1P97496 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms