Protein–RNA interactions for Protein: P97470

Ppp4c, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4cP97470 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp4cP97470 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp4cP97470 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp4cP97470 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp4cP97470 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp4cP97470 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp4cP97470 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp4cP97470 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp4cP97470 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp4cP97470 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp4cP97470 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp4cP97470 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp4cP97470 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ppp4cP97470 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp4cP97470 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp4cP97470 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp4cP97470 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp4cP97470 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp4cP97470 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ppp4cP97470 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ppp4cP97470 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp4cP97470 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp4cP97470 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp4cP97470 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp4cP97470 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp4cP97470 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp4cP97470 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp4cP97470 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp4cP97470 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp4cP97470 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppp4cP97470 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms