Protein–RNA interactions for Protein: P81269

Atf1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf1P81269 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf1P81269 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf1P81269 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf1P81269 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf1P81269 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf1P81269 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf1P81269 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf1P81269 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf1P81269 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atf1P81269 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf1P81269 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf1P81269 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf1P81269 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf1P81269 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf1P81269 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf1P81269 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf1P81269 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf1P81269 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf1P81269 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf1P81269 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf1P81269 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf1P81269 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf1P81269 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf1P81269 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf1P81269 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf1P81269 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atf1P81269 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf1P81269 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf1P81269 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf1P81269 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf1P81269 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms