Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx1P80205 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx1P80205 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx1P80205 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx1P80205 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx1P80205 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx1P80205 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx1P80205 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms