Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CiitaP79621 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CiitaP79621 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CiitaP79621 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CiitaP79621 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CiitaP79621 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CiitaP79621 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CiitaP79621 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CiitaP79621 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CiitaP79621 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms