Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfi1P70338 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfi1P70338 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfi1P70338 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms