Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprvP70289 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprvP70289 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprvP70289 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprvP70289 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprvP70289 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprvP70289 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprvP70289 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PtprvP70289 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprvP70289 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprvP70289 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprvP70289 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprvP70289 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PtprvP70289 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprvP70289 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprvP70289 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms