Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chl1P70232 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Chl1P70232 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chl1P70232 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chl1P70232 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chl1P70232 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Chl1P70232 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chl1P70232 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chl1P70232 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chl1P70232 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chl1P70232 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chl1P70232 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chl1P70232 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Chl1P70232 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chl1P70232 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms