Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrig1P70193 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrig1P70193 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms