Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta1P68134 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta1P68134 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Acta1P68134 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta1P68134 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta1P68134 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta1P68134 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta1P68134 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acta1P68134 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acta1P68134 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acta1P68134 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acta1P68134 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acta1P68134 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms