Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps27aP62983 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27aP62983 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms