Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Depdc5P61460 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Depdc5P61460 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Depdc5P61460 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms