Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arf3P61205 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Arf3P61205 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Arf3P61205 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arf3P61205 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Arf3P61205 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arf3P61205 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arf3P61205 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arf3P61205 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Arf3P61205 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arf3P61205 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Arf3P61205 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Arf3P61205 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms