Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sf3b6P59708 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms