Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhbdl3P58873 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rhbdl3P58873 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rhbdl3P58873 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms