Protein–RNA interactions for Protein: P57791

Rce1, CAAX prenyl protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rce1P57791 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rce1P57791 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rce1P57791 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rce1P57791 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rce1P57791 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rce1P57791 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rce1P57791 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms