Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TdgP56581 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TdgP56581 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TdgP56581 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TdgP56581 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TdgP56581 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TdgP56581 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TdgP56581 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TdgP56581 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TdgP56581 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TdgP56581 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TdgP56581 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TdgP56581 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TdgP56581 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TdgP56581 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TdgP56581 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TdgP56581 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TdgP56581 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TdgP56581 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TdgP56581 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TdgP56581 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TdgP56581 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TdgP56581 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TdgP56581 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TdgP56581 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TdgP56581 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TdgP56581 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TdgP56581 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TdgP56581 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TdgP56581 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TdgP56581 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TdgP56581 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TdgP56581 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TdgP56581 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TdgP56581 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TdgP56581 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TdgP56581 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TdgP56581 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TdgP56581 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TdgP56581 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TdgP56581 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TdgP56581 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TdgP56581 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TdgP56581 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TdgP56581 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TdgP56581 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TdgP56581 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TdgP56581 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TdgP56581 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TdgP56581 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TdgP56581 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TdgP56581 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TdgP56581 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TdgP56581 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TdgP56581 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TdgP56581 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TdgP56581 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TdgP56581 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TdgP56581 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TdgP56581 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TdgP56581 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TdgP56581 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TdgP56581 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TdgP56581 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TdgP56581 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TdgP56581 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TdgP56581 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TdgP56581 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TdgP56581 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TdgP56581 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TdgP56581 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TdgP56581 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TdgP56581 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TdgP56581 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TdgP56581 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TdgP56581 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TdgP56581 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TdgP56581 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TdgP56581 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TdgP56581 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TdgP56581 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TdgP56581 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TdgP56581 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TdgP56581 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TdgP56581 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TdgP56581 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TdgP56581 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TdgP56581 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TdgP56581 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TdgP56581 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TdgP56581 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TdgP56581 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TdgP56581 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TdgP56581 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TdgP56581 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TdgP56581 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TdgP56581 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TdgP56581 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TdgP56581 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TdgP56581 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms