Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf5P56477 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf5P56477 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf5P56477 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf5P56477 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf5P56477 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf5P56477 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf5P56477 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf5P56477 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf5P56477 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf5P56477 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irf5P56477 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf5P56477 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf5P56477 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms