Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtskP55097 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtskP55097 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CtskP55097 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtskP55097 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtskP55097 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtskP55097 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtskP55097 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtskP55097 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtskP55097 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtskP55097 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtskP55097 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtskP55097 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CtskP55097 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtskP55097 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtskP55097 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtskP55097 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtskP55097 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtskP55097 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtskP55097 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtskP55097 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtskP55097 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtskP55097 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtskP55097 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtskP55097 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtskP55097 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtskP55097 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtskP55097 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtskP55097 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtskP55097 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtskP55097 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtskP55097 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtskP55097 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtskP55097 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CtskP55097 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtskP55097 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtskP55097 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtskP55097 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtskP55097 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtskP55097 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtskP55097 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtskP55097 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtskP55097 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtskP55097 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtskP55097 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtskP55097 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtskP55097 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtskP55097 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtskP55097 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtskP55097 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtskP55097 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtskP55097 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtskP55097 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtskP55097 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtskP55097 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtskP55097 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CtskP55097 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtskP55097 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtskP55097 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtskP55097 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtskP55097 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtskP55097 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtskP55097 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtskP55097 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtskP55097 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtskP55097 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtskP55097 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtskP55097 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtskP55097 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtskP55097 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CtskP55097 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtskP55097 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtskP55097 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CtskP55097 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtskP55097 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CtskP55097 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtskP55097 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtskP55097 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtskP55097 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtskP55097 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtskP55097 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtskP55097 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtskP55097 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CtskP55097 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtskP55097 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtskP55097 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtskP55097 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtskP55097 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtskP55097 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CtskP55097 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtskP55097 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtskP55097 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtskP55097 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtskP55097 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtskP55097 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtskP55097 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CtskP55097 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CtskP55097 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CtskP55097 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CtskP55097 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms