Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acod1P54987 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acod1P54987 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Acod1P54987 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Acod1P54987 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Acod1P54987 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Acod1P54987 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acod1P54987 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acod1P54987 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Acod1P54987 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms