Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ephb3P54754 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ephb3P54754 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms