Protein–RNA interactions for Protein: P52815

MRPL12, 39S ribosomal protein L12, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL12P52815 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL12P52815 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL12P52815 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms