Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ApodP51910 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ApodP51910 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ApodP51910 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ApodP51910 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ApodP51910 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ApodP51910 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ApodP51910 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ApodP51910 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ApodP51910 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ApodP51910 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ApodP51910 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ApodP51910 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ApodP51910 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ApodP51910 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ApodP51910 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ApodP51910 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ApodP51910 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ApodP51910 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ApodP51910 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ApodP51910 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ApodP51910 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ApodP51910 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ApodP51910 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ApodP51910 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ApodP51910 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ApodP51910 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ApodP51910 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ApodP51910 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ApodP51910 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ApodP51910 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ApodP51910 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ApodP51910 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ApodP51910 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ApodP51910 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ApodP51910 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ApodP51910 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ApodP51910 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ApodP51910 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ApodP51910 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ApodP51910 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ApodP51910 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ApodP51910 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ApodP51910 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ApodP51910 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ApodP51910 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ApodP51910 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ApodP51910 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ApodP51910 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ApodP51910 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ApodP51910 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ApodP51910 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ApodP51910 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ApodP51910 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ApodP51910 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ApodP51910 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ApodP51910 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ApodP51910 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ApodP51910 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ApodP51910 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ApodP51910 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ApodP51910 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ApodP51910 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ApodP51910 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ApodP51910 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ApodP51910 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ApodP51910 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ApodP51910 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ApodP51910 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ApodP51910 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ApodP51910 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ApodP51910 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ApodP51910 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ApodP51910 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ApodP51910 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ApodP51910 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ApodP51910 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ApodP51910 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ApodP51910 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ApodP51910 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ApodP51910 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ApodP51910 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ApodP51910 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ApodP51910 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ApodP51910 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ApodP51910 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ApodP51910 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ApodP51910 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ApodP51910 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ApodP51910 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ApodP51910 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ApodP51910 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ApodP51910 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ApodP51910 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ApodP51910 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ApodP51910 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ApodP51910 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ApodP51910 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ApodP51910 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ApodP51910 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms