Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccr5P51682 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms